La metodología utilizada en la elaboración de este Plan de Manejo permitió la participación de los diferentes sectores involucrados y la incorporación de diferentes profesionales que enriquecieron técnicamente las distintas propuestas para mejorar el manejo del Parque Nacional Tortuguero.
Es una metodología similar a la utilizada en otros procesos de planificación como por ejemplo la elaboración de los Planes de Manejo del Monumento Nacional Guayabo (2001) y del Parque Nacional Volcán Irazú (2002), aplicada por el CATIE, WWF y SINAC. Además, se enmarcó dentro de la norma emitida por el Sistema Nacional de Áreas de Conservación (SINAC) para elaborar los planes de manejo de las Áreas Silvestres Protegidas (ASP) de Costa Rica.
El proceso de planificación se desarrolló en tres etapas:
- Etapa de diagnóstico
- Etapa de fundamento técnico para el manejo
- Etapa propositiva de las estrategias de manejo
En cada etapa se elaboraron estudios y recomendaciones que sirvieron de insumo para la siguiente etapa. Mediante siete talleres de trabajo con representantes de comunidades, de instituciones públicas, de ONG, de municipalidades y de la empresa privada, se discutieron y mejoraron los resultados o propuestas, que son las que en definitiva las que componen el Plan de Manejo.
El proceso de elaboración del Plan de Manejo del PNT contó con una comisión permanente de ocho personas, compuesta por el Director, el Subdirector, la Coordinadora de ASP (gerente), el Coordinador de Planificación (gerente) y el Administrador del PNT, todos funcionarios del ACTo; un Codirector del Proyecto COBODES y los dos Coordinadores del Plan de Manejo, los cuales llevaron el control metodológico y técnico del proceso de planificación.
Plan de manejo del Parque Nacional Tortuguero (Spanish) 
